En 1970 fue elegido máximo dirigente sindical campesino del departamento de La Paz.

También jugó un papel estratégico posicionando el katarismo como propuesta en el marco de las luchas sociales y políticas en Bolivia.

[3]​ Tras tres gestiones consecutivas como máximo líder de la CSUTCB, Flores tuvo que dejar el cargo.

La sigla quedó en manos de la fracción encabezada por Vïctor Hugo Cárdenas.

Estudió derecho en la Universidad Mayor de San Andrés donde fundó con otros compañeros - entre ellos Raimundo Tambo precursor del sindicalismo independiente- el Movimiento Universitario Julián Apaza (MUJA).

[6]​ Después de dos semanas del Congreso, pasaron a la clandestinidad, algunos de sus dirigentes fueron exiliados y otros encarcelados debido al golpe militar del General Hugo Banzer.

[8]​ En 1985 fue candidato a las elecciones presidenciales con el Movimiento Revolucionario Tupak Katari logrando el 2.11 por ciento del voto.

En su intervención pidió apoyo para el Gobierno del presidente Morales para que "derrote definitivamente a los partidos tradicionales".