Los genes superpuestos están presentes y son una característica fundamental tanto en los genomas celulares como virales.
[2] La definición actual de un gen superpuesto varía significativamente entre eucariotas, procariotas y virus.
[2] En procariotas y virus, la superposición debe ser entre secuencias codificantes, pero no entre transcritos de ARNm, y se define cuando estas secuencias codificantes comparten uno o más nucleótidos en la misma cadena o en cadenas opuestas.
Esta definición incluye tanto las regiones no traducidas (UTR) 5′ y 3′ como los intrones.
Los genes pueden superponerse de varias formas y pueden clasificarse por sus posiciones relativas entre sí.