Comandó el USS Boston (el cuarto de ese nombre, botado en 1825, portaba 18 cañones).
Tras dejar el Río de la Plata, se dirigió al Golfo de México y participó en la guerra con México en 1846.
En 1856 asumió el mando de la fragata USS Merrimack, que tras su comando sería destruida y con cuyos restos se construiría el buque de la escuadra Confederada CSS Virginia.
Durante la guerra civil recibió el mando del USS Cumberland.
Su sobrino, el teniente Austin Pendergrast estuvo al mando del USS Congress, el que fue hundido por su antigua nave, el CSS Virginia.