Más cerca del borde aparecen los cráteres Levi-Civita al suroeste, y Beijerinck hacia el norte-noreste.
Isaev se encuentra en su totalidad dentro del contorno noroeste de Gagarin.
En contraste con el suelo de Gagarin, Isaev tiene un piso con un albedo algo bajo.
Este cráter ha sido fuertemente erosionado por una larga historia de impactos posteriores.
Por convención estos elementos son identificados en los mapas lunares poniendo la letra en el lado del punto medio del cráter que está más cerca de Gagarin.