Cerca del pueblo hay un bosque de encinas que ocupa aproximadamente unas 9 hectáreas.

La localidad está situada a una altitud de 930 m sobre el nivel del mar.

Se encuentra en el límite con las provincias de Burgos y Valladolid.

[6]​ La inversión térmica es frecuente en Fuentesoto, especialmente en invierno, en situaciones anticiclónicas fuertes que impiden el ascenso del aire y concentran la poca humedad en el valle, dando lugar a nieblas persistentes y heladas.

Este fenómeno finaliza cuando al calentarse el aire que está en contacto con el suelo se restablece la circulación normal en la troposfera; suele ser cuestión de horas, pero en condiciones meteorológicas desfavorables la inversión puede persistir durante días.