Su padre era capitán de un barco ballenero y Frederick pasó mucho tiempo de su juventud aprendiendo a manejar botes.
[3] Slocum solicitó la excedencia durante los años 1908 y 1909 para estudiar en el Observatorio Astronómico Real de Potsdam, Alemania.
Asistió a Samuel A. Mitchell en la investigación de técnicas de medida del paralaje, cuyos resultados se publicaron en 1913.
En 1914 se convirtió en el primer profesor de astronomía en la Universidad Wesleyana, en la que planificó y supervisó la construcción del Observatorio Van Vleck.
Nombrado director del observatorio en 1915, conservó este puesto hasta 1944.