Hijo de un cerrajero mecánico, Frédéric Cailliaud se sintió atraído desde muy joven por las ciencias naturales, en particular por la mineralogía y la geología.

Al regresar a Nantes en 1819, llevó una gran colección de minerales, inscripciones y antigüedades que fueron adquiridas por el gobierno francés para el Museo de Historia Natural.

Remontó el valle del Nilo hasta la sexta catarata con Ismail y el guardiamarina Pierre-Constant Letorzec.

Fue, con el seudónimo de Mourad Effendi, el primer europeo en entrar en esta región.

Legó parte de su colección al Museo Arqueológico Dobrée, en Nantes.