A partir de 1947 obtiene plaza oficial en el Archivo General de Navarra, entonces dirigido por José Ramón Castro Álava y lo compagina con la docencia en los PP.En esos años se licencia en Filosofía y Letras en la Universidad de Zaragoza.Posteriormente llegará a ser su director hasta la jubilación.[1] En 1977 obtiene el doctorado con una tesis sobre el Valle de Roncal.La obra escrita del archivero Idoate es muy amplia y abarca temas y épocas variados,[3] pormenorizando en recogida de materiales sumamente valiosos, no sólo desde el estricto punto de vista histórico sino también desde el antropológico y lingüístico.
Portada del
Catálogo de los Cartularios Reales del Archivo General de Navarra
(recreada) de
Florencio Idoate