La empresa fue conformada en Massachusetts, Estados Unidos en 1880, abriendo su primera línea ferroviaria en 1884 para enlazar la Ciudad de México con Ciudad Juárez.
La línea cruzaba el Río Grande en El Paso, Texas, teniendo conexiones con el Ferrocarril Pacífico Sur y otras empresas ferroviarias de los Estados Unidos (Texas y Pacific Railway, Atchison, Topeka & Santa Fe.).
En 1905 la empresa también compró al Ferrocarril Coahuila y Pacífico, el cual unía Torreón con Saltillo y operaba una línea paralela de Gómez Palacio a Monterrey.
Este ferrocarril llegó a controlar por traspaso, construcción y renta, líneas ferroviarias que en total sumaban 5,055 kilómetros o sea una tercera parte de los ferrocarriles construidos...» [3] El gobierno mexicano tomó control de la empresa en 1906, para finalmente en febrero de 1909 entregarla a Ferrocarriles Nacionales de México.
[1][4] Durante la mayor parte del siglo anterior, el sistema ferroviario siguió en poder de la paraestatal, y es hasta 1990 que, siguiendo los procesos de privatización de empresas estatales promovido por el gobierno mexicano, se conforma la empresa Ferromex quien adquirió la mayoría de la infraestructura iniciada por el Ferrocarril Central Mexicano, a excepción del ramal de Chicalote a Tampico, la cual fue asignada a la empresa Transportación Ferroviaria Mexicana, conocida actualmente como Kansas City Southern de México.