Posteriormente en Estados Unidos estancias posdoctorales en la University of Southern California en Los Ángeles (Profs.
Desde 1996 a 2012 colaboración permanente de investigación en Stanford University con el Grupo del Prof.
John Ross, como Visiting Scholar e investigador asociado en proyectos de National Science Fundation (USA) y NATO Collaborative Research Grants.
Dirigido y participado en varios cursos de la European School of Theoretical Biology, en Francia.
Investigador Principal en sucesivos proyectos competitivos (Plan Nacional, Consolider-Ingenio, Programas Marco Europeos, Proyectos Comunidad de Madrid) en dinámica de sistemas complejos, redes metabólicas, redes neuronales, evolución molecular, origen de la vida y dinámica molecular.