Fue promovido al rango de general durante las Guerras Revolucionarias francesas.

Durante las Guerras napoleónicas, dirigió una división en 1805 y un cuerpo de ejército en 1809.

El año siguiente participó en los asedios de Landrecies y Charleroi.

[1]​ En 1796, Hohenzollern fue nombrado general mayor y fue transferido a Italia.

[4]​ Jugó un papel reducido en la batalla de Arcole, donde los austríacos se ven forzados a retirarse.

[9]​ Tras la caída de Génova, Ott le nombra comandante del puerto recién capturado.

En 1802 se convierte en propietario del regimiento n.º 2 de caballería ligera, empleo que conservaría hasta su muerte.

Werneck intentó huir alcanzando la orilla norte del Danubio, siendo perseguido por Murat.

Finalmente en octubre de 1805, Werneck capituló pero el príncipe se negó a entregar las armas, huyendo a Bohemia junto con el archiduque Fernando, y Karl Schwarzenberg y diez escuadrones de caballería.

Durante los Cien días, continuó comandando el segundo cuerpo del ejército dirigido por Karl Schwarzenberg, pero no tuvo una gran participación en la campaña.