Todos los cargos son elegidos por elección popular y directa por un período de un año.
[4][5][6][7][8] Está gobernada por un órgano gubernamental colegiado, la Mesa Ejecutiva, cuyas autoridades son escogidas mediante elecciones directas en las que participa el estudiantado que integra cada carrera profesional de la universidad.
Durante esa época, la FEPUCV fue un actor relevante en el movimiento estudiantil que abogaba por un enfoque de "co-gobierno" y una universidad más abierta.
[11] En 2018-2019, la FEPUCV experimentó una breve presidencia del sector reformista, aunque pronto fue eclipsada por otras corrientes progresistas.
A pesar de la derrota del proyecto constitucional en el plebiscito constitucional de 2022, estas fuerzas han mantenido su influencia en la federación estudiantil siendo dirigida en los últimos años principalmente por el Frente Amplio y las Juventudes Comunistas.