Actualmente juega en la A lyga, máxima categoría nacional.
Los orígenes del Kauno Žalgiris se remontan a la creación en 2004 de la escuela de fútbol «Tauras», cuyo principal club era el «FK Spyris».
La entidad jugaba en las categorías inferiores lituanas desde la temporada 2005; ocho años después obtuvo el ascenso a la Primera Liga, en la que permanecería dos ediciones más.
[2] Pese a ser colista en 2016 y 2017, mantuvo la categoría en ambas ocasiones por descensos administrativos de sus rivales.
[3] Eivinas Černiauskas Nerijus Maciulis Alexander McCarthy Paulius Ragauskas Mantas Gintalas Plantilla en la web oficial