El estrecho de San Juanico (en inglés, San Juanico Strait) es un estrecho marino localizado en el archipiélago filipino, que separa la isla de Samar, al norte, de la isla de Leyte, al sur.

El estrecho es atravesado tanto por el puente de San Juanico como por una línea aérea de la compañía HVDC Leyte - Luzon, que lo cruza con una torre sobre una isla deshabitata.

Los españoles fueron quienes nombraron este estrecho.

[1]​ Durante esta expedición fallida, un barco solo, el pequeño San Juan de Letrán, con una tripulación mínima de solo 20 hombres, reconoció más de 5.000 kilómetros en aguas del archipiélago filipino, incluidas las del estrecho de San Bernardino —entre Luzón y Leyte— y el estrecho de San Juanico.

[1]​ El San Juan también circunnavegó completamente la isla de Mindanao, y luego trató de llegar a México, pero fue arrojado a las islas Marianas por una tormenta en el Pacífico Norte.