La historia del estonio meridional como lengua escrita comienza con la traducción del Nuevo testamento (Wastne Testament) en 1686, mucho antes de que existiese una traducción al estonio septentrional.
El estonio meridional tuvo su época de auge entre los siglos XVII y XIX.
A fines del siglo XIX el estonio meridional se encontraba ya completamente marginalizado.
Por sobre todo el võro ha ganado fuerza, debido a que se difunde en las escuelas y en los medios regionales.
El tartu y el mulgi, en cambio, son lenguas, que al menos en cuatro idiomas escritos se encuentran prácticamente extinguidos.
Entre los autores importantes que actualmente escriben en estonio meridional se cuentan los poetas Mats Traat y Nikolai Baturin (ambos nacidos en 1936).
En épocas muy recientes (desde 2000) se han llevado a cabo estudios mucho más precisos acerca de los contactos entre el estonio y el finés.
Algunas de las diferencias son las siguientes: Meie Esä taiwan: pühendetüs saagu sino nimi.
Ni saatku-i meid joht kiusatusõ sisse, a pästäq meid ärq kur’ast, selle et sino perält om riik ja vägi ni avvustus igävädses aos.
Meie isa, kes Sa oled taevas: pühitsetud olgu Sinu nimi.