Las obras corrieron a cargo de la Compañía del Ferrocarril de Tudela a Bilbao creada en 1857.

[3]​ En 1878, fue absorbida por Norte que mantuvo la titularidad de la estación hasta la nacionalización del ferrocarril en España en 1941 y la creación de RENFE.

Se sitúa al norte del núcleo urbano al final de la avenida de la Vía.

Alfaro está conectada con ciudades como Madrid, Barcelona, Zaragoza, Logroño y Bilbao gracias a trenes Alvia.

El tráfico de Media Distancia con parada en la estación tiene como principales destinos Zaragoza y Logroño.