[2]​ En 1939, tras finalizar la Guerra Civil Española, y con la creación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), la Escuela entró a formar parte de este nuevo organismo y, consecuentemente, siguiendo sus directrices, se dedicó principalmente a la investigación.

La casa principal se organiza en torno a un gran patio rectangular, cuyo lado mayor coincide con la dirección norte-sur.

Los otros elementos nazaríes reutilizados son las columnas de mármol blanco que sostienen los arcos del pórtico norte.

Cuando Lorenzo el Chapiz decidió adaptar la casa a al gusto y necesidades de su época, construyó la planta alta, al menos en los tres lados conservados hoy, ya que de hacerlo también en el lado sur, habría perdido las apreciadas vistas desde las galerías hacia la Alhambra y el Generalife.

Tanta fama alcanzó la ventana que algunos años después inició un viaje sin retorno al Museo Arqueológico Nacional (Madrid).

Las galerías están construidas en madera, con baranda de balaustres torneados que denota influencias del gusto renacentista.

Para describir esta casa morisca, de tamaño mucho menor que la anterior empezaremos por su zaguán, que tiene los vanos descentrados para dificultar la visión directa hacia su patio rectangular con pequeña alberca en el centro.