Algunas estructuras biológicas tales como los ribosomas se ajustan a esta definición, dado que, mientras trabajaban en el entorno de una célula reciben instrucciones del ARN mensajero y montan secuencias específicas de aminoácidos para constituir proteínas.Sin embargo, el término «ensamblador molecular» generalmente se refiere a dispositivos teóricos artificiales o sintéticos.[1] Sin embargo, el término «ensamblador molecular» también se utiliza en la ficción y la cultura popular para describir una gama de máquinas fantásticas que manipulan átomos, muchas de las cuales pueden ser físicamente imposibles en la realidad.Sin embargo, hasta hace poco, no hubo ninguna investigación sobre la construcción real de ensambladores moleculares.Asimismo, el término "ensamblador molecular" se ha utilizado en la ciencia ficción y la cultura popular para referirse a una amplia gama de fantásticas nanomáquinas que manipulan átomos, muchas de las cuales pueden ser físicamente imposibles en la realidad.Gran parte de la controversia sobre los "ensambladores moleculares" se debe a la confusión en el uso del nombre tanto para conceptos técnicos como para fantasías populares.En este artículo se habla sobre todo de "ensambladores moleculares" en el sentido popular.Son bastante diferentes de los dispositivos que simplemente (como se ha definido anteriormente) "guían las reacciones químicas colocando moléculas reactivas con precisión atómica".Debido a que nunca se han construido ensambladores moleculares sintéticos y a la confusión sobre el significado del término, ha habido mucha controversia sobre si los "ensambladores moleculares" son posibles o simplemente ciencia ficción.Un sistema que se propone es la nanofábrica en la cual las nanomáquinas, que se asemejan a ensambladores moleculares o a brazos robóticos industriales, combinan moléculas por medio de reactivos mecanosintéticos para construir piezas más grandes atómicamente precisas.En 2005, John Burch, en colaboración con Drexler, produjo un cortometraje animado por ordenador sobre el concepto de nanofábrica.Estas visiones han sido objeto de mucho debate, en varios niveles intelectuales.Si se pudieran construir nanofábricas, uno de los muchos impactos negativos posibles sería la grave perturbación de la economía mundial, aunque se podría argumentar que esta perturbación tendría poco efecto negativo si todo el mundo tuviera esas nanofábricas.Varias obras de ciencia ficción han explorado estos y otros conceptos similares.Sin embargo, si la autorreplicación de los ensambladores moleculares no se limitara, podría dar lugar a una competencia con los organismos naturales.Smalley creía que esos ensambladores no eran físicamente posibles y presentó objeciones científicas al respecto.Existe una preocupación muy real por el posible impacto sanitario y ecológico de la nanotecnología que se está integrando en los productos manufacturados.La financiación de la investigación que se basa en la capacidad de los investigadores para producir demostraciones experimentales que se vinculen a modelos abstractos y guíen la visión a largo plazo es la más adecuada para lograr este objetivo."