Juega como mediocampista por izquierda y su primer equipo fue Unión de Santa Fe.
[1] Nacido en Paraná, Emanuel Moreno comenzó su carrera en el club Argentinos Juniors de esa ciudad, hasta que en el año 2009 decidió trasladarse a Santa Fe para sumarse a las inferiores de Unión.
Ese día, el técnico Fernando Alí dispuso su ingreso a los 44 minutos del ST en reemplazo de Matías Donnet.
Durante su estadía en Lomas de Zamora, Moreno jugó 52 partidos y convirtió 2 goles (frente a su ex equipo, Douglas Haig, e Independiente Rivadavia).
Convirtió su primer gol dos meses después tras la victoria a Estudiantes de San Luis por 2-0.