Fueron las segundas elecciones municipales desde la restauración de la alcaldía electa y la democratización del país en 1994.
El alcalde incumbente, Chen Shui-bian, se presentó a la reelección, debiendo competir contra Ma Ying-jeou, del Kuomintang.
Aunque el Partido Nuevo Chino (CNP), que había dividido el voto de centroderecha reunificacionista en 1994 y posibilitó la victoria de Chen, también presentó un candidato, Wang Chien-shien, en esta ocasión Ma contaba con el apoyo directo del presidente de la república, Lee Teng-hui, y mantuvo una campaña favorable a la taiwanización sin perder el voto desfavorable a la misma.
En gran medida debido a esto último, Ma obtuvo una holgada victoria con el 51.13% de los votos contra el 45.91% obtenido por Chen.
El resultado fue divisivo geográficamente, con Ma imponiéndose en los distritos al sur de la ciudad y Chen en los del norte.