El 3 de diciembre de 2024 se instaló el Consejo Local del Instituto Nacional Electoral en el estado de Baja California, que serán los encargados de la realización de las elecciones en el Estado.
[4] Los siguientes cargos serán elegidos a nivel federal, con excepción de los magistrados de la Primera Sala Regional del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación que serán elegidos por la circunscripción electoral correspondiente, siendo en el caso de Baja California la primera circunscripción electoral con sede en Guadalajara, la cual corresponde también a los estados de Baja California Sur, Chihuahua, Durango, Jalisco, Nayarit, Sinaloa y Sonora.
Los siguientes cargos, serán elegidos únicamente en el estado de Baja California y en el municipio de San Luis Río Colorado, Sonora; corresponden a los juzgadores federales radicados XV Circuito Judicial, correspondiente a la totalidad del estado de Baja California, radicados en tres sedes: Mexicali, Tijuana y Ensenada.
Para esta elección, y con el fin de armonizar el marco geográfico utilizado por el Instituto Nacional Electoral y el usado por el Poder Judicial de la Federación, el Instituto Nacional Electoral, decidió crear los denominados distritos judiciales electorales, los cuales tomaron como referencia, los distritos electorales federales y los cargos a elegir por cada circuito judicial, resultando de tal manera que para el estado de Baja California se definieron dos distritos judiciales, divididos de la siguiente forma:[5] Cada distrito judicial, elegirá a determinado número de magistrados y jueces de distrito, correspondiendo al Distrito 1, siete magistrados de circuito y ocho jueces de distrito; y por su parte, al Distrito 2, siete magistrados de circuito y nueve jueces de distrito.
Correspondiente a los distritos electorales federales 1, 2, 3 y 7, que abarcan los municipios de Ensenada, Mexicali, San Felipe y San Quintín, de Baja California y San Luis Río Colorado, de Sonora.