Jugó en su equipo de altos funcionarios hasta 2004, cuando fue prestado a Barcelona Sporting Club para jugar en sus categorías superiores y los equipos sub-20.

En 2005, fue prestado al Club Sport Emelec donde solo jugó 3 partidos, y luego fue al Club Deportivo El Nacional, en la categoría sub-20.

En 2007 estuvo en la Liga de portoviejo, jugó con Sociedad Deportivo Quito, donde haría una gran temporada y realizó múltiples asistencias.

En Liga marcó 6 goles en 13 partidos, y fue campeón de la Copa Libertadores 2008.

Edder Vaca acuerda con Centro Deportivo Olmedo para la segunda etapa de la Serie B 2013.