Fue profesor de ciencias naturales en Brunswick.
Es autor de uno de las primeros libros sobre la distribución geográfica de los mamíferos, Specimen Zoologiae Geographicae Quadrupedum (1777).
Realizó viajes científicos a Inglaterra, Italia, Francia, Rusia y Suecia.
Uno de sus alumnos fue Carl Friedrich Gauss.
La abreviatura Zimmermann se emplea para indicar a Eberhard August Wilhelm von Zimmermann como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.