Es la secuela de Earthworm Jim y Earthworm Jim 2, y el primer juego de la serie en no ser desarrollado por Shiny Entertainment, ya que los derechos habían sido vendidos a Interplay Entertainment y más tarde paso a manos de VIS Entertainment.

Además de que también se planeaba una versión para la Sony Playstation, lamentablemente siendo cancelada por razones desconocidas.

Luego, Jim despierta dentro de su propia mente y descubre que se ha vuelto loco.

Sus villanos del pasado han entrado a su mente y si no hace algo pronto, Jim se quedará en coma para siempre.

[1]​ Varios lugares que fueron presentados en versiones tempranas del juego no estaban incluidas en la copia final (como un nivel que tiene lugar en una casa y Jim tiene el tamaño de una hormiga).

Además, el juego estaba basado libremente en la serie de televisión, la cual para el momento del lanzamiento del juego había sido cancelada hacía más de tres años, complicando la campaña promocional.

[4]​ Perry y el creador original de la serie, Doug TenNapel estuvieron involucrados inicialmente en el juego como consultores menores, pero fueron despedidos por razones no publicadas.

[10]​ IGN fue un poco más indulgente con la versión de Nintendo 64, dándole una calificación de 7.3 sobre 10, elogiando su sonido, los gráficos y su presentación, pero aún criticando la cámara y lo poco atractivo que se volvía el juego a la larga.