Varios estudios arqueológicos en la región demuestran que Ayvalık y sus alrededores fueron habitados desde la era prehistórica.

Beksaç identificó las huellas de una colina en la isla Çıplak o Chalkys.

La amenaza constante que representó la piratería en la región durante las épocas antiguas no permitió que los asentamientos de los islotes crecieran y solo en la isla Cunda hubo mayor presencia de habitantes, por ser la isla más grande y cercana al continente.

Según lo informado por el entonces embajador británico lord Strangford, Osman Pasha, los lugareños se habían rendido, pero él les permitió mantener sus armas; todo permaneció tranquilo en la ciudad, hasta que en la lejanía del mar apareció repentinamente un gran escuadrón de insurgentes griegos que motivó a los habitantes a levantarse en armas, creyendo que venían por su ayuda, cuando en realidad su paso por la zona fue accidental.

Exportaron grandes cantidades de este hacia Francia e Italia.

Los trabajadores repatriados recibían salarios, pero no se les permitía vivir en sus propios hogares y estaban bajo vigilancia oficial[3]​ Hasta 1922, Ayvalık estuvo poblada casi exclusivamente por griegos.

La ciudad está unida por un puente y una calzada a la isla Lale, que a su vez se conecta con la isla Cunda; las únicas dos islas habitadas de las islas Ayvalık que rodean la ciudad.

Actualmente se halla a una corta distancia en automóvil de las ruinas de 3 importantes ciudades antiguas: Pérgamo al este (hoy Bergama) y Aso y Troya al norte.

En los últimos años, Ayvalık también se ha convertido en un importante punto de atracción para los buceadores con escafandra autónoma, por su fauna submarina.

Los ferris operan diariamente entre Ayvalık y Mitilene en la cercana isla de Lesbos, Grecia.

La producción comercial comenzó en la década de 1950 y se hizo prominente en los 60s.