Volvió a Paraguay en 2010 y disputó ocho temporadas en la primera división, incluso fue goleador en la campaña 2012 con Guaraní.

Llegó al Atlético Caaguazú, donde jugaba uno de sus hermanos mayores, a los 14 años.

[3]​ En su vuelta al Paraguay, Centurión tenía todo acordado para fichar por un club capitalino de la Primera División.

[3]​ Debutó el 18 de abril en la fecha 5 ante Sportivo Iteño, jugando los 90 minutos del 0-0 final.

Disputó 13 partidos y convirtió 6 goles, entre ellos, un doblete ante Deportivo Santaní en la fecha 25, penúltima del torneo.

Y su tercer y último gol del torneo lo convirtió el 11 de diciembre en la fecha 21, en lo que fue una derrota locataria por 3-2 ante Olimpia, equipo que saldría campeón una fecha después.

Debutó el 30 de julio en la fecha 1 del Torneo Clausura 2012 con un doblete ante Cerro Porteño en La Olla Azulgrana, marcando en dos minutos consecutivos (minutos 73 y 74), para dar vuelta el resultado de 0-1 a 2-1 a favor.

La segunda rueda del torneo comenzó por la buena senda, ya que en la fecha 12, disputada el 19 de octubre, anotó un gol en la victoria de su equipo jugando como local ante Cerro Porteño por 2-1, alargando así su racha a tres fechas consecutivas marcando goles.

Sin embargo, Guaraní (al igual que Centurión) no pudo mantener el alto nivel mostrado hasta ese momento (tan solo cosechó 2 puntos en los siguientes 5 partidos).

Recién en la fecha 18 "recobraron la memoria", al ganarle por 1-0 con gol del Lungo a Cerro Porteño (PF), el 21 de noviembre.

Sin embargo, culminaron en el tercer lugar con 43 puntos, a 4 de distancia del campeón Libertad.

No obstante, Diego Centurión terminó cumpliendo una destacada actuación, finalizando como máximo anotador del mismo, con 13 goles (lideró la tabla de goleadores en todas las fechas —22— del torneo) en 21 partidos jugados (20 como titular).

Además, se pueden destacar sus 3 dobletes (2 en partidos consecutivos, fechas 1 y 2), sus goles representaron casi el 50% de los goles totales de su equipo, y cada vez que él marcó su equipo siempre ganó.

[7]​ El Torneo Apertura 2013 no se pareció en nada al torneo anterior para Centurión, ya que solo jugó 11 partidos (de los cuales la mayoría ingresó desde el banco de suplentes) y no marcó ningún gol.

Sin embargo, su equipo sí tuvo un buen torneo, ya que consiguieron el subcampeonato con 40 puntos, a 6 de distancia del campeón Nacional.

[9]​ Su debut llegó el 10 de agosto en la fecha 3 del Torneo Clausura 2013 y nuevamente, al igual que en Guaraní, haciendo dupla con Dante López en el ataque (único partido del torneo que Centu arrancó como titular).

Ya en la fecha 6 del día 23 de marzo, Centurión fue alineado en el equipo titular para enfrentar a su clásico rival, Cerro Porteño.

Olimpia terminó en la 6° ubicación con 30 puntos, a 16 de distancia del campeón Libertad.

Finalizó el torneo con 5 partidos jugados (2 como titular) y ningún gol, y Sportivo Luqueño ubicado en el 5° puesto con 34 puntos, a 18 de distancia del campeón Cerro Porteño.