El clima es un clima diurno típico, en el que las diferencias de temperatura a lo largo del día son más pronunciadas que a lo largo del año.

Desde La Paz, la carretera pavimentada Ruta 2 conduce al oeste durante trece kilómetros hasta El Alto, y desde allí la Ruta 1 recorre durante 96 kilómetros al suroeste a través de Laja, Tiahuanaco y Guaqui hasta llegar a Desaguadero.

En 1880, Desaguadero se convirtió en la primera localidad boliviana conectada con La Paz por una línea telegráfica, junto con Puerto Pérez.

Desaguadero es una importante estación intermedia en el eje interoceánico entre el Pacífico y el Atlántico.

Desde aquí la conexión va hasta Puerto Suárez en las tierras bajas del sureste de Bolivia, en la frontera con Brasil.