Durante las guerras o las emergencias asume la autoridad sobre el sistema sanitario civil en Israel.El Cuerpo planifica, organiza y supervisa los preparativos del sistema de salud para hacer frente a posibles crisis.En el año 2011, el cuerpo era dirigido por el General de Brigada Dr. Itzik Kryce.Está subordinado al Directorio de Tecnología y Logística.El Cuerpo Médico está dividido en seis unidades; El centro de Servicios Médicos, está dirigido por un coronel, y es la principal unidad operacional del cuerpo, consiste en cuatro centros regionales de servicios médicos.