[1]​ El río y sus afluentes fluyen por la selva del Congo.

Por su caudal el río es el tercer río más caudaloso del mundo, superado solo por el Amazonas y el complejo del Ganges-Brahmaputra-Meghna; y es uno de los ríos más profundos del mundo, alcanzando profundidades que superan los 220 m.[2]​[3]​ Debido a que su cuenca comprende sectores tanto al norte como al sur del ecuador, su caudal es estable, ya que siempre hay por lo menos un sector del río en el cual es la temporada de lluvias.

[4]​ Las fuentes del Congo son las tierras altas y montañas del Rift de África Oriental, como también el lago Tanganica y el Mweru, que alimenta al río Lualaba, que se convierte en el Congo después de las cataratas Boyoma.

El Congo fluye en dirección norte desde Kisangani justo luego de las cataratas Boyoma, luego gradualmente se orienta en dirección suroeste, pasando por Mbandaka, uniéndose con el río Ubangi y fluyendo en la Pool Malebo (Stanley Pool).

Kinshasa (antiguamente Léopoldville) y Brazzaville se encuentran en orillas opuestas del río en la Pool, donde el río se angosta y cae por diversas cataratas en profundos cañones (denominadas en conjunto cataratas Livingstone), atravesando Matadi y Boma y desembocando en el mar junto al pequeño poblado de Muanda.