Su tío Jorge Alberto actuó como regente hasta 1664, cuando Cristián Ernesto fue declarado adulto y asumió el gobierno del principado.
Cristián Ernesto tomó decisiones atrevidas en centralizar las autoridades regionales en Bayreuth, asentando a los hugonotes en Erlangen, y creando una Academia de Caballeros (en alemán: Ritterakademie), la base para la Universidad Regional de Erlangen (en alemán, Landesuniversität Erlangen).
Desde 1668 armar sus propios dominios (con lo que pretendía al principio ayudar al emperador) forzó las finanzas del estado y expuso Bayreuth a peligros militares.
En 1695 el arquitecto Leonhard Dientzenhofer comenzó la construcción de la torre del castillo octogonal.
En 1686 permitió a los hugonotes expulsados por Luis XIV residir en Neustadt; poco después permitió también que residieran en Erlangen los refugiados del Palatinado, que fue devastado durante la guerra de Sucesión del Palatinado.