Los departamentos del antiguo GUGB pasaron a denominarse directorios.
Por ejemplo, el antiguo Departamento de Relaciones Exteriores (INO) se convirtió en el Directorio de Relaciones Exteriores (INU); la policía política representada por el Departamento Político Secreto (SPO) se convirtió en la Directorio Político Secreto (SPU), y así sucesivamente.
Su primer vicecomisario fue Iván Serov, un antiguo comisario de tercer rango de la Seguridad del Estado, y dos adjuntos, Bogdan Kobúlov y Mijáil Gribov.
Durante los cambios de 1943, NKGB se volvió a crear como Comisariado independiente.
Otras razones que declara Dziak son: el impacto causado por la agresión alemana y el rápido avance de su ejército.