El comercio transíndico ha sido un factor clave en los intercambios entre Occidente y Oriente a lo largo de la historia.
Los puertos poco profundos ubicados en los estuarios de los ríos que desembocan en el mar permitían un rápido comercio marítimo con las ciudades.
Esta red comercial se expandió para llegar hasta África y la Península arábiga, lo que resultó en la colonización austronesia de Madagascar en la primera mitad del primer milenio d. C. Continuó hasta tiempos históricos, convirtiéndose más tarde en la Ruta Marítima de la Seda.
[17] Los tres principales puertos romanos implicados en el comercio oriental eran Arsínoe, Berenice y Myos Hormos.
Arsínoe fue uno de los primeros centros comerciales, pero pronto fue eclipsado por Myos Hormos y Berenice, que eran más accesibles.
[19] Los romanos repararon y limpiaron el canal sedimentado desde el Nilo hasta el centro del puerto de Arsínoe en el Mar Rojo.
[21] Aventurarse a estos puertos del norte presentaba dificultades adicionales como bajíos, arrecifes y corrientes traicioneras.
Myos Hormos y Berenice parecen haber sido importantes puertos comerciales antiguos, posiblemente utilizados por los comerciantes faraónicos del antiguo Egipto y la dinastía ptolemaica antes de caer bajo el control romano.
[27] Huntingford señala además que se encontró cerámica romana en Arikamedu en 1937, y las excavaciones arqueológicas entre 1944 y 1949 mostraron que era una estación comercial a la que se importaban bienes de fabricación romana durante la primera mitad del siglo I d. C. Después de las guerras romano-sasánidas, las áreas bajo el Imperio Romano Bizantino fueron capturadas por Cosroes II de la dinastía persa sasánida,[28] pero el emperador bizantino Heraclio las reconquistó (628).
La representación del siglo VIII de un barco Borobudur navegando en la antigua Java sugiere que existían antiguos vínculos comerciales a través del Océano Índico entre Indonesia y Madagascar y África Oriental, veces conocida como la Ruta de la Canela.
Las flotas chinas bajo el mando de Zheng He atravesaron el Océano Índico durante la primera parte del siglo XV.
Las misiones eran más diplomáticas que comerciales, pero se hicieron muchos intercambios de obsequios y productos.
El comercio a través del océano Índico introdujo gradualmente la escritura árabe y el arroz como alimento básico en África oriental.
[36][37] Nuevas oleadas de inmigrantes austronesios llegaron a Madagascar en este momento dejando un legado cultural y genético duradero.
[33] La trata de esclavos europea en el océano Índico comenzó cuando Portugal estableció el Estado da Índia a principios del siglo XVI.
En 1602, el ejército iraní bajo el mando del Imam-Quli Khan Undiladze logró expulsar a los portugueses de Baréin.
Lo reemplazó como centro comercial con un nuevo puerto, Bandar Abbás, cercano en el continente, pero nunca tuvo tanto éxito.
Por ejemplo, se utilizaron unos 4000 esclavos africanos para construir la fortaleza de Colombo en el Ceilán holandés.