El equipo comenzó jugando en la única división que había, en ese momento, para los jugadores mayores de 18 años.
El debut en categoría nacional se produce en la temporada 84/85 realizando un campeonato discreto en el que consigue la permanencia, siendo mucho mejor la campaña siguiente 85/86 en la que es sexto y a punto esta de dar la campanada quedando a escasos puntos de las dos primeras plazas.
La venta de algunos jugadores sin embargo afecta a la plantilla y en la temporada 86/87 retroceden al undécimo puesto, perdiendo la categoría en la 87/88 en un torneo en que llega a la última jornada necesitado de un punto y no lo consigue al perder por 1-2 en casa.
Este accidente deportivo les mantendrá seis largas temporadas en Preferente hasta que por fin al término de la campaña 92/93 consigan regresar a Tercera División.
Roquetas inicia esta segunda etapa con parámetros muy similares a su anterior presencia, obteniendo clasificaciones en torno a la zona media de la tabla y pasando incluso por algunos apuros para mantenerse como en el caso de las sesiones 97/98 y 98/99 ambas saldadas con un decimoquinto puesto.
Muy distinta resulta la temporada 10/11 con un grupo humano muy unido donde casi todos sus jugadores son capaces de marcar y donde la cohesión le permite acceder al séptimo puesto cuando con un poco más de fortuna rematadora se hubieran podido lograr más altas cotas.
El club no hace frente a las deudas contraídas con los jugadores; estos denuncian ante AFE, el presidente y su junta dimiten, se convocan elecciones.... no se presenta candidatura alguna y el equipo desciende, por impagos, de tercera división a primera división andaluza.
Después pasó al Campo "La Algaida" y hasta la temporada 2004/05, disputaba sus partidos como local en el Estadio Municipal Los Bajos.