[4] Martin presentó su idea al guitarrista Jon Buckland, quien le añadió acordes al tema básico:[5] «Él [Jon Buckland] tomó su guitarra (una certera señal de que le gustaba la canción) y tocó esos brillantes acordes... Fue como el proceso de una reacción química».[6] Antes de componer «Clocks», la banda ya había preparado diez canciones para el álbum.[6] Resolvieron grabar una versión del tema y guardarla con otros trabajos incompletos, etiquetando el archivo como «Canciones para el número tres»,[nota 1] dando a entender que iban a ubicar esos trabajos en su tercer álbum de estudio, X&Y.[6] Chris Martin canta, según sus propias palabras, sobre un estado de «impotencia [...] en una relación disfuncional que no puede terminarse».[5] La letra es críptica, y los versos finales de la segunda estrofa resaltan aún más esta característica: «Come out upon my seas/Cursed missed opportunities/Am I a part of the cure/Or am I part of the disease?».Rob Sheffield, en su revisión del álbum para la revista Rolling Stone, dijo que «[el guitarrista] Jon Buckland brilla en estas excelentes [canciones de] rock psicodélico como [...] “Clocks”».[15] El sencillo tuvo éxito en la radio durante 2003,[1] y se posicionó considerablemente bien en muchas listas a nivel mundial.[22] La canción «Should I Go» de la cantante estadounidense Brandy, incluida en su álbum Afrodisiac, utiliza una muestra de dichos arpegios, y sucede lo mismo con el sencillo del cantante mexicano Alejandro Fernández «Te voy a perder».[23] En 2009, el DJ francés David Guetta lanzó, junto a Kelly Rowland como sencillo «When Love Takes Over», que presenta otra muestra, así como la canción «Shining Down» de Lupe Fiasco con Matthew Santos.Una estructura similar puede ser escuchada en una remezcla de la canción «I Need You Now», también interpretada por este último dúo.El dúo noruego Röyksopp hizo una versión, siendo posible la descarga en su sitio web oficial.El sencillo además contiene una versión de «God Put a Smile Upon Your Face», junto al DJ Mr Thing.[25] El grupo chino Twelve Girls Band realizó una interpretación de la canción original para su álbum Eastern Energy.[27] Otra versión existe en el disco recopilatorio Rhythms del mundo, producido por el reconocida agrupación musical cubana Buena Vista Social Club, que incluye temas de diversos artistas de Gran Bretaña, Estados Unidos e Irlanda.
