José Luis Molina nació en Albacete y tras pasar su infancia en Francia con sus padres, regresó a su ciudad natal con 18 años y jugó en el equipo juvenil de División de Honor.

[1]​ En el Celta de Vigo sembró la cantera y sacó futbolistas que han acabado echando raíces en la plantilla profesional viguesa.

«Desde Yoel, el portero, a Túñez pasando por Roberto Lago, Hugo Mallo, Jonathan Vila o Dani Ábalo».

En 2011 llega al Real Valladolid para ocupar su secretaría técnica, ya que José Antonio García Calvo se convierte en el nuevo director deportivo del Real Valladolid,[2]​ donde los dos forman la plantilla, y quien ya tuvo una estrecha relación con Antonio Gómez, el entrenador del conjunto vallisoletano en ese momento, donde coincidió en el Albacete Balompié.

Durante las 3 campañas que estuvo en el club murciano, destaca la temporada 2013/14 configura la plantilla del Real Murcia con el presupuesto más austero de los últimos años, y elabora totalmente por su cuenta un equipo concebido para no pasar apuros y en club murciano juega play-offs de ascenso a Liga BBVA[3]​ En verano de 2014 el que ha sido coordinador deportivo del Real Murcia, confirmó su marcha como nuevo secretario técnico del Real Betis, donde vuelve a reunirse con un Julio Velázquez que mientras el Murcia peleaba por ascender a Primera, él se dedicaba a ultimar su fichaje por la entidad verdiblanca.