Tuvieron a dos grandes managers, el cubano Adolfo Luque, quien fue relevado por el sinaloense José Luis "Chile" Gómez.

En la primera vuelta, Guadalajara terminó en el sótano con marca de 18 ganados y 22 perdidos.

Su retorno a Guadalajara se dio en 1988, heredando un plantel sólido, los Ángeles Negros de Puebla.

Increíblemente, en 1989, se convirtieron en Industriales de Monterrey, cuya vigencia feneció en 1994, mudándose a Reynosa.

Con Armando Navarro y la familia Cosío Gaona invirtiendo, los Charros retornaron en 1991 (también en la expansión incluyó a los Cafeteros de Córdoba), pero resultó una etapa gris de cinco años en la que lo más sobresaliente fue Fernando Valenzuela (1992 y 1994), finalmente en 1995 la franquicia de los Charros tuvo que ser vendida a Oaxaca.

Al consagrarse campeón de LaMP 2021/22, el conjunto logra su boleto para participar en la Serie del Caribe 2022 celebrado en Santo Domingo.

Llevándose 3 juegos ganados por 2 perdidos, logrando avanzar a las Semifinales, donde sufrió la derrota por parte de Gigantes del Cibao quedando en cuarto lugar en el torneo caribeño.

Participó en la Liga Mexicana de Béisbol en 21 temporadas, ganando el campeonato en dos ocasiones.

Los dos campeonatos los recuerda la afición tapatía con nostalgia, orgullo y cariño, pero especialmente el segundo por haber logrado el título luego de estar abajo en la serie por tres juegos a cero ante los Saraperos de Saltillo.

En la temporada 2017-18 (2017-18), los Charros presumieron su primera temporada ganadora tras dos perdedoras y calificaron a la postemporada en la quinta posición, curiosamente se enfrentaría a los finalistas de esa temporada, pues derrotó a los Tomateros de Culiacán 4-3 en la primera ronda, pero serían eliminados por los Mayos de Navojoa en la segunda ronda.

En la temporada 2018-19 (2018-19), los Charros tuvieron un buen inicio que se derrumbó en los siguientes partidos debido al inconstante pitcheo que los dejaría en la séptima posición en la primera vuelta, sin embargo el cambio en el cuerpo de técnicos, impulso a Charros a lograr la cuarta posición en la segunda vuelta y conseguir la clasificación en la sexta posición.

Con una primera vuelta regular y una segunda vuelta extraordinaria, en la que quedaron segundos, Charros calificó a playoff, eliminando a Águilas de Mexicali en el primer playoff.

En la final, se enfrentaron a los Tomateros de Culiacán por tercera vez en su historia.

La novena jalisciense debutó en la justa caribeña en la Serie del Caribe 2019 en Ciudad de Panamá.

La tercer participación ocurrió en la Serie del Caribe 2025 en Mexicali, Baja California.