Tanto Manipur como Assam se vieron envueltos en las disputas entre Tailandia y Birmania.
Durante la Segunda Guerra Mundial, Manipur fue el escenario de numerosas batallas entre los japoneses y las fuerzas aliadas.
En la actualidad (2005) en el estado de Manipur existen numerosos grupos armados separatistas que iniciaron sus acciones poco después de la independencia del país y que siguen plenamente activos.
Manipur está también envuelto en una disputa territorial con el estado de Nagaland.
Sólo pueden entrar con un permiso especial que expide escasamente el Ministerio del Interior.
Como estado bajo protectorado británico Manipur tuvo hasta 1907 dos banderas, una blanca y otra roja con una serpiente.
El escudo de Manipur incluye la serpiente con corona real sobre una media luna protegida por laureles, y dos lanzas cruzadas con banderola con los colores nacionales.