Así, en 1850, en el Sínodo de Thurles, se decidió abrir una nueva institución en Dublín especialmente para los católicos.

[3]​ Como entidad privada, la Universidad Católica nunca recibió una Carta Real, por lo que no podía otorgar títulos válidos y sufría severas dificultades económicas.

El cardenal Cullen estaba en contra de educar a laicos y clérigos bajo las mismas premisas.

Patrick's University se anunciaban clases nocturnas por parte de la universidad, bajo el nombre del Dr. Woodlock.

En 1863 la Universidad Católica de Irlanda otorgó su primer Doctorado en Divinidad a James Vincent Cleary (profesor y más tarde presidente del St.

John's College, Waterford, y futuro Obispo de Kingston, Canadá), utilizando su carta papal para otorgar títulos en teológía.

Newman tuvo poco éxito en establecer la nueva universidad, aunque se habían recaudado más de £250.000 entre los laicos para financiarla.

Cuando comprendió esto, renunció a su rectorado y regresó al Oratorio.Posteriormente la escuela entró en una grave decadencia; en 1879 sólo se habían matriculado tres alumnos.

Dado que el Trinity College (del que su padre era rector) no admitía mujeres para estudiar, se trasladó a Trinity en 1904 cuando a las mujeres se les permitió estudiar allí.

De igual manera la doctora y misionera anglicana Marie Elizabeth Hayes estudió en Cecilia St.