Durante la dinastía Ming, misioneros como Matteo Ricci o Adam Schall estudiaron chino en esta casa antes de servir en la corte imperial de Pekín como geógrafos y matemáticos.
En su interior, la iglesia era de madera, y fue decorada con brillantez a la vez que amueblada con gusto.
Al lado, una cripta alberga los restos de los mártires japoneses y vietnamitas.
La impresionante fachada de granito se ha hecho a mano durante muchos años por los japoneses cristianos exiliados y artistas locales, bajo la dirección del jesuita italiano Carlo Spinola.
La fachada fue construida bajo el concepto clásico de la ascensión divina, por lo cual se divide en cinco niveles horizontales rematadas por un frontón triangular.
Por eso, el quinto y último nivel simboliza la Trinidad que vive en el Paraíso.