[5][6] El templo fue diseñado por Domingo de Petrés y se construyó entre 1807 y 1823 en el mismo lugar donde anteriormente se levantaron otros tres templos que sucesivamente sirvieron de catedrales para la ciudad.[10] Doce años después, Fray Juan de los Barrios, primer Arzobispo de la ciudad, trajo sobre sus hombros la primera piedra para una nueva Catedral, dando así ejemplo a todos sus compañeros y fieles, quienes siguiéndolo lograron almacenar una cantidad considerable de piedras para su construcción.La obra se inició el 12 de marzo de 1572, en el mismo lugar, con las mismas condiciones que la anterior, es decir con tres naves, pero con un detalle adicional en el que se le añadieron cuatro capillas formando una cruz.Cuando muere fray Domingo en 1811 la construcción del interior de la catedral estaba finalizada.La restauración arquitectónica comprendió la reposición de color en bóvedas, cúpula, columnas y paredes.[16] La nueva forma del presbiterio recrea su antiguo diseño aunque conserva la disposición litúrgica de hoy.Previó al inicio de la obra se realizó una investigación documental y arqueológica.En sí, el órgano es una orquesta con instrumentos como trompetas, bombardas, oboes, clarinetes, flautas y voces humanas.[18] Su ubicación exacta es entre la Carrera Séptima y la Carrera Sexta con Calles 10.ª y 11.ª, en la cual la portada se encuentra orientada hacia el occidente (sobre la Carrera Séptima, mirando hacia la Plaza de Bolívar) y la puerta lateral o puerta falsa se orienta hacia el norte (sobre la calle 11.ª, mirando hacia la Casa del Florero o Museo del 20 de julio, lugar en donde ocurrió el Grito de Independencia, y construcciones aledañas).[20] Al costado sur de la Catedral se encuentra la Capilla del Sagrario, templo construido entre 1660 y 1689.Las torres, reconstruidas después del terremoto de 1827 miden 52 metros de altura y parten de la cornisa mayor a manera de campanario, cada una está formada por tres cuerpos con vanos en los cuatro costados en el cuerpo superior para las campanas y en el cuerpo medio; la torre sur está consagrada a Santa Bárbara, mientras que la torre norte, consagrada a San Emigdio tiene un reloj.Al entrar a la catedral y hacia la derecha se ubica la nave sur, donde de occidente a oriente, lo primero que se observa es la Capilla del Baptisterio con la pila bautismal, una pila en piedra tallada del siglo XVIII, y detrás de ella, el cuadro "Bautismo de Cristo", óleo sobre tela pintado por el artista Ricardo Acevedo Bernal en 1898.En el costado occidental de la capilla se encuentra el cuadro "Jesús Niño y el Padre Eterno", óleo sobre tela del artista Pedro Figueroa.En este altar encontramos una imagen en madera tallada, de la Escuela Sevillana del siglo XVII.Al costado oriental de la capilla se encuentra el óleo sobre tela "Jesús con la Cruz a Cuestas".Desde la Catedral Basílica Metropolitana y Primada podemos acceder a la Capilla del Sagrario.En esta capilla se destaca la tumba del conquistador español y fundador de la ciudad Gonzalo Jiménez de Quesada, esculpida por el artista Luis Alberto Acuña sobre un altar en mármol blanco de Cassioli; en el muro oriental se destaca el busto del general Antonio Nariño en el lugar donde yacen sus restos.En el muro occidental un monumento en mármol contiene las cenizas del venezolano Pedro Gual y una placa recuerda al arzobispo Fernando Caicedo y Flores, complementados por un cuadro del Credo de Santiago y la estatua de María Inmaculada, la cual estuvo en el altar mayor durante tres siglos.[12] Cuatro columnas se apoyan en el escalón, las cuales contienen los restos de los arzobispos Aquinao Camacho, del Pórtico y Torres y unos pasos al sur se encuentra sepultado monseñor Juan Bautista Agnozzi, delegado de la Santa Sede que visitó la ciudad en 1882.Anteriormente llamada Capilla de la Virgen del Perpetuo Socorro (también llamada Santísima Trinidad), hoy en día se conoce como la Capilla de San Juan Nepomuceno, y fue elaborada en 1630.Tiene un altar dórico rodeado con una reja, una estatua de Nuestra Señora en un nicho y 4 cuadros laterales.[12] La segunda capilla de esta nave está dedicada al Santo Cristo (también conocida como las ánimas o las almas del purgatorio), contiene un altar de orden compuesto con una pequeña reja, un cuadro del Cristo Crucificado, dos cuadros pequeños al lado derecho y una pintura del Salvador de Vásquez.
La Catedral Basílica Metropolitana y Primada en los años 30. Nótese la antigua forma de las torres.