Ella sirvió casi continuamente como regente hasta 1596, donde entre sus otras responsabilidades, esta firme protestante acogió a Antonio Pérez del Hierro, un famoso católico español refugiado del rey Felipe II.

Nombrada por su hermano para sentarse en su Consejo como representante de los intereses protestantes franceses en 1598, se dedicó a convencer a los hugonotes a estar de acuerdo con el Edicto de Nantes.

Como parte del tratado de Saint-Germain-en-Laye entre Enrique IV y el duque Carlos III de Lorena, se acordó que Catalina debía casarse con el hijo mayor de Carlos, Enrique (1563-1624).

Sin embargo, Catalina era una calvinista convencida, que se negaba a convertirse al catolicismo romano, mientras que su marido era un católico devoto, y exmiembro de la Liga Santa.

Sin embargo, Catalina no estaría mucho tiempo casada antes de que muriera, sin hijos.