[1]​ Además ha desempeñado el cargo de secretario general y vocero del partido, senador suplente de 2000 a 2006, este último año ha sido electo senador plurinominal para el periodo que culmina en 2012.

Como consecuencia de su actividad política, durante la década de los ochenta Carlos Navarrete, junto con Jesús Ortega, Jesús Zambrano y Miguel Alonso Raya, fueron conocidos como “Los Coroneles”.

Desde el cual, al año siguiente, colaboró en la campaña presidencial del ingeniero Heberto Castillo Martínez y después en el movimiento del ingeniero Cuauhtémoc Cárdenas en el Frente Democrático Nacional.

En la LVI Legislatura volverá a ocupar un escaño como diputado federal perredista entre 1994 y 1997, en donde participó activamente en diversas comisiones, entre las que destacan las de Defensa Nacional y la de Comunicaciones y Transportes; así como las especiales de investigación por el caso CONASUPO y la de investigación por el caso Ruiz Massieu.

(enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).