Cisternas debutó en Colo-Colo, formó parte del plantel campeón del Clausura 2006, y subcampeón de la Copa Sudamericana 2006.

A inicios de 2011 volvió a Magallanes, en donde participa más activamente y permanece por casi siete años, siendo el estandarte y capitán del equipo.

Allí fue subcampeón de la Copa Chile 2011, al perder la final ante Universidad Católica.

[3]​ Para la temporada 2021, es anunciado como refuerzo del Rodelindo Román.

[5]​ Su única participación en la Selección chilena, fue en un amistoso disputado el año 2007, en el Estadio Germán Becker de Temuco, contra la Selección de Cuba.