En julio de 2004, siendo Secretario de Organización, fue elegido Secretario General del Partido Socialista de Navarra PSN-PSOE al vencer a Juan José Lizarbe Baztán, hasta entonces Secretario General.
En septiembre de 2006, pese a su voluntad expresada públicamente al respecto, acordó con la dirección federal del PSOE el nombramiento de Fernando Puras Gil como candidato del PSN a la Presidencia del Gobierno de Navarra, propuesta que fue aprobada por unanimidad en el seno de la Comisión Ejecutiva Regional y por el 99% de los votos en el Comité Regional del PSN-PSOE.
No obstante, continuó como Secretario General, cargo en el que vivió también el rechazo del Comité Federal del PSOE al pacto de Gobierno que se alcanzó en 2007 con Nafarroa Bai e IU-NEB.
Tras su funeral, que se celebró al día siguiente en la parroquia de Cintruénigo, su localidad natal, fue trasladado al crematorio de Tudela (Navarra), para ser incinerado en la mañana del día siguiente, tal y como era su última voluntad.
Sus cenizas fueron esparcidas por el monte al que iba a pasear habitualmente.