El nombre original del puerto era Yenecamú, topónimo de origen pericú ”.

[7]​ Se calcula que los primeros grupos humanos llegaron a la parte sur de la península hace unos 15 000 años.

Sin embargo se considera a Hernán Cortés como el «descubridor» de este lugar.

(*) En 1925 los hermanos Carlos y Luis Bernstein, quienes tenían una gran experiencia en el comercio, trasladan desde Isla de Cedros el Barco-fábrica “Calmex” a la bahía de Cabo San Lucas y lo instalan para el procesado del atún, que existía en abundancia en sus cercanías.

En 1927, los hermanos Bernstein fundaron la Compañía de Productos Marinos S.A. e iniciaron la construcción de nuevas instalaciones en tierra, construcción que debieron acelerar al máximo debido a que, en 1928, el barco-fábrica “Calmex” se hundió en la bahía al explotarle una caldera.

En 1929 se inauguran en tierra las nuevas instalaciones, mismas que después se integran a las empresas Rodríguez y después son vendidas al grupo Elías Pando quienes conservan la marca registrada en honor del barco-fábrica.

En 1979, la compañía de productos marinos no aguantó la presión y el empuje del desarrollo turístico y apagó su maquinaria; cerró sus puertas en Cabo San Lucas y se fue a Puerto San Carlos, “los habitantes del puerto se vieron drásticamente afectados por no contar con otra fuente de empleo similar.

Los trabajadores fueron liquidados, muchos migraron y otros más permanecen recordando los viejos tiempos y relegados por la nueva industria sin chimeneas” En 1951, el gobernador del Territorio de Baja California, general Agustín Olachea Avilés (1946-1956), inauguró la escuela primaria Naciones Unidas, actualmente el edificio ocupa el Museo de Historia Natural de Cabo San Lucas.

Cabo San Lucas recibe el tercer ataque de Kaiju, siendo destruida por completo.