Cuando se expone esta sustancia a luz ultravioleta, emite una luz roja-anaranjada, que se intensifica unas 20 veces después de haberse unido a una cadena de ADN.

[2]​ Actualmente existen otros compuestos que cumplen con la función del bromuro de etidio y que son vendidos como más seguros por, en teoría, no tener efecto mutagénico, como el Sybr Safe (Invitrogen), el Gel Red (Biotium) o el MIDORI green (Nippon Genetics).

Es común que el bromuro de etidio se diluya para así arrojarlo al desagüe.

[4]​ Según Lunn y Sansone, la degradación química usando blanqueadores es mutagénica por el test de Ames.

Limpiar también cualquier traza de esta sustancia en estado sólido con mucha precaución e intentando no crear polvo.