En 1834 fue enviado otra vez como representante de Costa Rica al Congreso Federal Centroamericano.
Ante esta pérdida del territorio nacional la República Federal de Centro América no hizo nada.
Braulio Carrillo fue candidato para reelegirse en las votaciones de 1837, pero fue derrotado por Manuel Aguilar Chacón, cuya política tendía a robustecer los nexos de Costa Rica con la República Federal, algo a lo que Carrillo era contrario.
Aun así, Don Braulio insistió en la importancia de enlazar a Costa Rica al mercado internacional del Océano Atlántico.
El proyecto de la carretera a la costa atlántica no pudo culminarse, pues Don Braulio Carrillo fue derrocado en 1842.
Para cuando Braulio Carrillo fue depuesto, ya había consolidado la economía cafetalera que unió a Costa Rica al mundo y cambió para siempre la economía, sociedad, cultura y política de este país.
En 1972, sus restos fueron traídos a Costa Rica y enterrados en San Rafael de Oreamuno.
Sin embargo, la situación de los demás países centroamericanos era turbulenta, enzarzados en guerras civiles y luchas intestinas, mientras Costa Rica vivía casi en paz.
"Carrillo podría tener unos cincuenta años. Era pequeño de cuerpo y grueso; sencillo pero cuidadoso en su modo de vestir. En su rostro se pintaba una resolución inquebrantable. Su casa era lo bastante republicana y nada había en ella que la distinguiese de la de cualquier otro ciudadano".John Lloyd Stephens . 1840. [ 2 ]