Con los diferentes gobiernos el presupuesto para la Biblioteca (que ya por el año 1876 había sido declarada pública) aumentó paulatinamente, generándose con esto una enorme cifra de volúmenes, la que obligó al Rector del Instituto, don Manuel Amunátegui, solicitar al presidente de la república una nueva sede para funcionar con mayor comodidad.

La información de ese acontecimiento es muy escasa, pero lo que sí se sabe es que el acervo se tuvo que repartir entre numerosas instituciones: 15.088 se enviaron a la Biblioteca Nacional; 6.666 al Instituto Pedagógico; 279 al , Liceo N.º 5 de hombres José Victorino Lastarria ; 1.493 al Internado Nacional; 1.057 a la Universidad de Chile, entre otros; y el Instituto, debido a falta de espacio, sólo pudo conservar una cifra aproximada a 14.300 volúmenes.

El fondo histórico se compone con los libros de la Biblioteca hasta el año 1950 d. C. que ascienden en número cercano a los 20.000 volúmenes.

Además numerosos libros entre el año 1500 y 1700, entre los que encontramos la "Histórica Relación del Reyno de Chile" escrito por el Padre Alonso Ovalle.

La biblioteca posee además una pequeña colección de manuscritos americanos que datan desde 1688 en adelante, entre cuyos tesoros encontramos documentos relacionados con la independencia, como por ejemplo: "Expediente del colegio de Sn.