San Francisco es la segunda iglesia construida por los franciscanos en Arezzo, siendo la anterior iglesia una construida en las afueras de los muros de la ciudad y que resultó destruida durante la Segunda Guerra Mundial.
Al interior parece una gran iglesia sencilla sin ornamentos, con una amplia nave, flanqueada en el lado izquierdo por algunas capillas y, en el lado derecho, por algunos nichos.
Bajo la iglesia hay una Chiesa inferiore (iglesia inferior) más pequeña, como en Asís, con una nave central y dos laterales, ahora usada como sala de exposiciones.
También contiene una Maesta o «Virgen en Majestad» de Guido da Siena.
Las paredes y particularmente los nichos de la derecha tienen también algo de decoración al fresco, que data en parte del siglo XIV.