Bang Khun Thian es un antiguo distrito, cuyo origen se sitúa en 1867 como un amphoe de Thon Buri.
En 1972, Thon Buri y la provincia de Phra Nakhon se fusionaron en la metrópoli de Bangkok, y las unidades administrativas resultantes fueron denominadas khet y los subdistritos kwaeng.
En 1989, Bang Khun Thian Branch 1 se convirtió en un distrito con el nombre de Chom Thong.
En 1997, el subdistrito de Bang Bon fue separado de Bang Khun Thian y se constituyó su distrito propio.
Un grupo de macacos de la zona (Macaca fascicularis, en tailandés, ลิงแสม), viven en la costa cerca del mar.